为什么Gapdh内参不适合做内参?
Gapdh是什么?
Gapdh全称为Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,是糖解酶途径中的一种酶。在此过程中,Gapdh不断催化丙酮酸和磷酸为糖原,同时在细胞中起到调节作用。因此,Gapdh被广泛应用作为内参基因来进行实时荧光定量PCR反应,以矫正外部条件下的实际差异。然而,近年来研究发现,Gapdh内参表达存在许多局限性和不足之处。
Gapdh内参存在的问题
首先,Gapdh内参的表达稳定性并不是完全可靠的。研究表明,该基因在不同的组织和细胞类型中表现出的表达量差异较大,长期以来已知其表达会受到多种因素的影响,如病毒感染、药物刺激、细胞死亡等,因此其数据的准确性和一致性就不可靠。
其次,Gapdh的表达量相对较高,过度集中的表达会干扰其它基因的表达数据,导致误判和偏差,特别是需要检测表达量较低的目标基因时,对其效果不理想。同时,Gapdh作为糖解酶途径中的一种酶,其表达水平也受到糖底物和酶协定子的影响,可能会在常规实验条件下产生偏移。
其他内参选择
鉴于Gapdh内参的不足,研究中需要仔细挑选更加适合的内参基因,以提高实验的准确性和稳定性。近年来,文献中出现了与Gapdh不同的多种替代内参基因,如beta-actin、18s rRNA、GAP-43、CycA、Ub等。这些基因的表达级别相对稳定,同时受外界因素的影响较小,因此更加适用于实验的需要。
总的来讲,Gapdh内参不适合做内参的原因主要是其表达稳定性及其表达量高的问题。为了更准确地检测目标基因的表达情况,我们需要在实验中认真挑选适合的内参基因,并对其合理标准化进行分析和选择。